MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. P-stx-12

Total Repeats: 100290

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016832	ATTG	2	8	40	47	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016832	AT	3	6	55	60	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016832	CAG	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016832	AGAC	2	8	153	160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016832	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016832	CAC	3	9	204	212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_016832	ACC	2	6	217	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_016832	A	6	6	274	279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016832	T	8	8	303	310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016832	AAC	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016832	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958131
12	NC_016832	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	378958131
13	NC_016832	TGG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958131
14	NC_016832	GAT	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958131
15	NC_016832	A	6	6	491	496	100 %	0 %	0 %	0 %	378958131
16	NC_016832	CGG	2	6	501	506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958131
17	NC_016832	T	6	6	545	550	0 %	100 %	0 %	0 %	378958131
18	NC_016832	GC	3	6	575	580	0 %	0 %	50 %	50 %	378958131
19	NC_016832	CTG	2	6	664	669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958131
20	NC_016832	CGC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958131
21	NC_016832	A	6	6	716	721	100 %	0 %	0 %	0 %	378958131
22	NC_016832	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	378958131
23	NC_016832	CTG	2	6	796	801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958131
24	NC_016832	CGC	2	6	858	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958131
25	NC_016832	TGG	2	6	932	937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958131
26	NC_016832	CCG	3	9	965	973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958131
27	NC_016832	GCC	2	6	979	984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958131
28	NC_016832	CTG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958131
29	NC_016832	CT	3	6	1105	1110	0 %	50 %	0 %	50 %	378958131
30	NC_016832	CGA	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958131
31	NC_016832	AAC	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958131
32	NC_016832	GAT	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958131
33	NC_016832	GGC	2	6	1329	1334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958131
34	NC_016832	CGC	2	6	1344	1349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958131
35	NC_016832	GGT	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958131
36	NC_016832	TCC	2	6	1390	1395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378958131
37	NC_016832	TG	3	6	1417	1422	0 %	50 %	50 %	0 %	378958131
38	NC_016832	GC	3	6	1436	1441	0 %	0 %	50 %	50 %	378958131
39	NC_016832	CCG	2	6	1446	1451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958131
40	NC_016832	GCT	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958131
41	NC_016832	TGT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958131
42	NC_016832	TTC	2	6	1582	1587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958131
43	NC_016832	AATATC	2	12	1606	1617	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378958131
44	NC_016832	TCT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958131
45	NC_016832	TGG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378958131
46	NC_016832	ACG	2	6	1670	1675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958131
47	NC_016832	CCA	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958131
48	NC_016832	CGG	2	6	1755	1760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958131
49	NC_016832	CGG	2	6	1764	1769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958131
50	NC_016832	GAA	2	6	1809	1814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958131
51	NC_016832	GCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958131
52	NC_016832	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958131
53	NC_016832	TTG	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958131
54	NC_016832	TCG	2	6	2086	2091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958131
55	NC_016832	ACT	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958131
56	NC_016832	CGC	3	9	2118	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958131
57	NC_016832	CTG	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958131
58	NC_016832	TGA	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958131
59	NC_016832	CT	3	6	2254	2259	0 %	50 %	0 %	50 %	378958131
60	NC_016832	TC	3	6	2292	2297	0 %	50 %	0 %	50 %	378958131
61	NC_016832	GC	3	6	2314	2319	0 %	0 %	50 %	50 %	378958131
62	NC_016832	CG	3	6	2345	2350	0 %	0 %	50 %	50 %	378958131
63	NC_016832	GAC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958131
64	NC_016832	GCC	2	6	2524	2529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958131
65	NC_016832	TGA	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958131
66	NC_016832	AGGTA	2	10	2553	2562	40 %	20 %	40 %	0 %	378958131
67	NC_016832	ATT	2	6	2684	2689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958131
68	NC_016832	TGC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958131
69	NC_016832	ATG	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958131
70	NC_016832	CGG	3	9	2741	2749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958131
71	NC_016832	AGC	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958132
72	NC_016832	GCC	2	6	2968	2973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958132
73	NC_016832	A	7	7	3060	3066	100 %	0 %	0 %	0 %	378958132
74	NC_016832	CGT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958132
75	NC_016832	CGC	2	6	3112	3117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958132
76	NC_016832	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	378958132
77	NC_016832	GCA	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958132
78	NC_016832	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958132
79	NC_016832	GAA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958132
80	NC_016832	ATT	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958132
81	NC_016832	CAG	2	6	3287	3292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958132
82	NC_016832	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958132
83	NC_016832	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	378958132
84	NC_016832	GCC	2	6	3464	3469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958132
85	NC_016832	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958132
86	NC_016832	CG	4	8	3503	3510	0 %	0 %	50 %	50 %	378958132
87	NC_016832	GC	3	6	3558	3563	0 %	0 %	50 %	50 %	378958132
88	NC_016832	CGG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958132
89	NC_016832	AGT	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958132
90	NC_016832	CAG	2	6	3809	3814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958133
91	NC_016832	T	8	8	3819	3826	0 %	100 %	0 %	0 %	378958133
92	NC_016832	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958133
93	NC_016832	GCA	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958133
94	NC_016832	CG	3	6	3962	3967	0 %	0 %	50 %	50 %	378958133
95	NC_016832	CGG	2	6	4060	4065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958133
96	NC_016832	GCG	2	6	4098	4103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958133
97	NC_016832	CGGCG	2	10	4144	4153	0 %	0 %	60 %	40 %	378958133
98	NC_016832	GTC	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958133
99	NC_016832	CG	3	6	4206	4211	0 %	0 %	50 %	50 %	378958133
100	NC_016832	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958133
101	NC_016832	TGA	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958133
102	NC_016832	GAA	2	6	4331	4336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958133
103	NC_016832	GCC	2	6	4383	4388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958133
104	NC_016832	CTA	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958133
105	NC_016832	CTG	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958133
106	NC_016832	CGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958133
107	NC_016832	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	378958133
108	NC_016832	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	378958133
109	NC_016832	GGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378958133
110	NC_016832	CCG	2	6	4681	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958133
111	NC_016832	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	378958133
112	NC_016832	GCG	2	6	4718	4723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958133
113	NC_016832	ACA	2	6	4741	4746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958133
114	NC_016832	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958133
115	NC_016832	AAAG	2	8	4880	4887	75 %	0 %	25 %	0 %	378958133
116	NC_016832	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958133
117	NC_016832	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	378958133
118	NC_016832	GCC	2	6	4985	4990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958133
119	NC_016832	ATG	2	6	5003	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958133
120	NC_016832	GTG	2	6	5062	5067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016832	TG	3	6	5148	5153	0 %	50 %	50 %	0 %	378958134
122	NC_016832	TCA	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958134
123	NC_016832	AAT	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378958134
124	NC_016832	TCA	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958134
125	NC_016832	CG	3	6	5251	5256	0 %	0 %	50 %	50 %	378958134
126	NC_016832	T	6	6	5258	5263	0 %	100 %	0 %	0 %	378958134
127	NC_016832	ACC	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958134
128	NC_016832	TCA	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958134
129	NC_016832	TTC	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378958134
130	NC_016832	CAC	3	9	5384	5392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958134
131	NC_016832	CG	3	6	5470	5475	0 %	0 %	50 %	50 %	378958134
132	NC_016832	AG	3	6	5552	5557	50 %	0 %	50 %	0 %	378958134
133	NC_016832	TGT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958134
134	NC_016832	CAAAAT	2	12	5578	5589	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	378958134
135	NC_016832	CGT	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958134
136	NC_016832	GCG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958134
137	NC_016832	GCT	2	6	5788	5793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378958134
138	NC_016832	AATCAG	2	12	5873	5884	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	378958134
139	NC_016832	A	7	7	5924	5930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016832	CGC	2	6	5931	5936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_016832	CG	3	6	5971	5976	0 %	0 %	50 %	50 %	378958135
142	NC_016832	ACC	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958135
143	NC_016832	CAA	2	6	6110	6115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378958135
144	NC_016832	A	6	6	6266	6271	100 %	0 %	0 %	0 %	378958135
145	NC_016832	CGA	2	6	6301	6306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958135
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150	NC_016832	GCCA	2	8	6664	6671	25 %	0 %	25 %	50 %	378958135
151	NC_016832	GGCG	2	8	6790	6797	0 %	0 %	75 %	25 %	378958135
152	NC_016832	GAT	2	6	6815	6820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958135
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154	NC_016832	GC	3	6	6889	6894	0 %	0 %	50 %	50 %	378958135
155	NC_016832	CGA	2	6	6940	6945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958135
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161	NC_016832	CCGCG	2	10	7184	7193	0 %	0 %	40 %	60 %	378958135
162	NC_016832	GCC	2	6	7226	7231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958135
163	NC_016832	TGAA	2	8	7290	7297	50 %	25 %	25 %	0 %	378958135
164	NC_016832	AGC	2	6	7332	7337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958135
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166	NC_016832	TTG	2	6	7408	7413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958135
167	NC_016832	TGA	2	6	7428	7433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
168	NC_016832	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
169	NC_016832	CGG	2	6	7505	7510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_016832	CGT	2	6	7599	7604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_016832	ATC	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_016832	CAC	2	6	7697	7702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378958136
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177	NC_016832	CAG	2	6	7866	7871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378958136
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191	NC_016832	CTGT	2	8	8666	8673	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
192	NC_016832	CCTT	2	8	8674	8681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
193	NC_016832	AAT	2	6	8722	8727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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202	NC_016832	TCC	2	6	9346	9351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
203	NC_016832	GGA	2	6	9359	9364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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218	NC_016832	ATA	2	6	10017	10022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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248	NC_016832	TCGT	2	8	11124	11131	0 %	50 %	25 %	25 %	378958140
249	NC_016832	TCTTT	2	10	11323	11332	0 %	80 %	0 %	20 %	378958141
250	NC_016832	TTA	2	6	11333	11338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958141
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253	NC_016832	A	6	6	11424	11429	100 %	0 %	0 %	0 %	378958141
254	NC_016832	T	6	6	11430	11435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_016832	TGA	2	6	11447	11452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
256	NC_016832	GTG	2	6	11487	11492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
257	NC_016832	A	8	8	11499	11506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_016832	TTA	2	6	11541	11546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_016832	ATG	2	6	11562	11567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
260	NC_016832	ATT	2	6	11603	11608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958142
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263	NC_016832	TGGT	2	8	11739	11746	0 %	50 %	50 %	0 %	378958142
264	NC_016832	GCC	2	6	11814	11819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378958142
265	NC_016832	GAA	2	6	11831	11836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958142
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268	NC_016832	GAA	2	6	11953	11958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958142
269	NC_016832	GAA	2	6	11962	11967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378958142
270	NC_016832	ATC	2	6	12095	12100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378958142
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393	NC_016832	T	6	6	17330	17335	0 %	100 %	0 %	0 %	378958148
394	NC_016832	GAT	2	6	17367	17372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958148
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397	NC_016832	ATT	2	6	17618	17623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378958149
398	NC_016832	GTT	2	6	17710	17715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958149
399	NC_016832	GTT	2	6	17734	17739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378958149
400	NC_016832	ATC	2	6	17763	17768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
401	NC_016832	T	6	6	17797	17802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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468	NC_016832	TGA	2	6	21196	21201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958152
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491	NC_016832	GTA	2	6	22218	22223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378958152
492	NC_016832	A	7	7	22228	22234	100 %	0 %	0 %	0 %	378958152
493	NC_016832	GGC	3	9	22259	22267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958152
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497	NC_016832	CGG	2	6	22426	22431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378958152
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